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Bioinformática · Acceso completo por invitación

scTrain

Un recorrido interactivo por la secuenciación de ARN de célula única: por qué medir célula por célula, cómo las gotas y los códigos de barras separan a las células, cómo se cuentan moléculas con UMI y cómo se pasa de la matriz de conteos a tipos celulares. Termina con un error clásico: tratar a las células como réplicas. Al final puede analizar sus datos en Overtone Single-Cell.

Nivel de entrada
Intermedio
Antes de empezar
Nociones de expresión génica.
Qué necesita
Células y matrices de conteos de práctica.
Qué obtiene
Comprensión del recorrido desde gotas y UMI hasta tipos celulares.
Primera práctica sugerida
Reserve 20–30 min para una primera práctica. Es una sugerencia de estudio, no la duración total.
Disponibilidad
Disponible para cuentas con aprobación de este recurso.

Sin cuenta · Ejemplo didáctico

Explore scTrain en pequeño.

Esta demostración explica un concepto con datos de práctica. El espacio completo y sus funciones se describen en la ficha.

Qué puede hacer

  • Cargue más células en las gotas y vea crecer los multipletes
  • Filtre células dañadas y dobletes con la verdad simulada a la vista
  • Recalcule UMAP y Leiden, nombre los clústeres y compare con pseudobulk

Sus datos y sus resultados

La demostración pública utiliza ejemplos de práctica. El aula requiere aprobación. El guardado, la importación y la exportación dependen del módulo; revise sus controles antes de cerrar la sesión.

Consultar guardado, exportación y eliminación

Alcance y límites

Recurso educativo con modelos simplificados. Sus ejercicios no sustituyen la validación de un método experimental.

Cómo empezar

  1. Revise los requisitos y explore la demostración cuando esté disponible.
  2. Solicite acceso a este recurso con su correo.
  3. Si se aprueba su solicitud, recibirá las indicaciones para entrar. La solicitud no crea una cuenta ni garantiza una fecha de apertura.