Bioinformática · Acceso completo por invitación
Overtone Single-Cell
Suba la salida de Cell Ranger o una tabla de conteos y avance por el análisis estándar de célula única: control de calidad y dobletes, normalización, genes variables, PCA, vecinos, Leiden, UMAP, marcadores, anotación y expresión diferencial. Todo corre en su navegador.
- Nivel de entrada
- Intermedio
- Antes de empezar
- Una matriz de conteos y conocimiento del diseño experimental.
- Qué necesita
- Matrices 10x MTX, .tar.gz o .zip y tablas CSV/TSV.
- Qué obtiene
- QC, agrupamientos, UMAP, marcadores y guiones de scanpy/Seurat.
- Para planificar su sesión
- El tiempo y el tamaño admisible dependen de la memoria del dispositivo.
- Disponibilidad
- Disponible para cuentas con aprobación de este recurso.
Qué puede hacer
- Matrices 10x (MTX, .tar.gz o .zip) y tablas CSV/TSV
- Calidad, dobletes (Scrublet), Leiden y UMAP
- Marcadores, anotación y guiones de scanpy y Seurat
Sus datos y sus resultados
El análisis se realiza en el navegador. Descargue los resultados antes de cerrar la pestaña; iniciar sesión no equivale a guardar el análisis en su cuenta.
Consultar guardado, exportación y eliminaciónAlcance y límites
Las células de una misma muestra no son réplicas biológicas independientes. Uso en investigación. Revise supuestos, calidad de entrada y resultados; no ofrece una validación clínica.
Cómo empezar
- Revise los requisitos y explore la demostración cuando esté disponible.
- Solicite acceso a este recurso con su correo.
- Si se aprueba su solicitud, recibirá las indicaciones para entrar. La solicitud no crea una cuenta ni garantiza una fecha de apertura.